Dalam sesi berdurasi satu jam yang diwarnai hujan pada 10 menit terakhir itu, Stoner membukukan waktu tercepat 1 menit 31,796 detik. Dia mengalahkan tiga pebalap Yamaha serta rekan setimnya, Dani Pedrosa. Ini menjadi pole keempat pebalap Australia tersebut, setelah di Portugal, Catalunya, dan Belanda.
Sementara pebalap Yamaha, Ben Spies, akan start dari posisi kedua setelah catatan waktunya lebih lambat 0,193 detik. Posisi ketiga ditempati Dani Pedros, yang pada dua sesi latihan bebas hari pertama selalu menjadi yang terdepan.
Posisi keempat ditempati pebalap satelit Yamaha Tech 3, Cal Crutchlow. Mantan pebalap Superbike ini, yang digadang-gadang bakal mengisi satu tempat di tim pabrik Yamaha untuk 2013, mengalahkan pemimpin klasemen sementara yang juga merupakan pebalap utama Yamaha, Jorge Lorenzo.
Sementara itu pebalap tuan rumah, Stefan Bradl, harus puas berada di urutan keenam, meskipun di awal kualifikasi dia sempat bersaing di barisan depan. Pebalap LCR Honda ini terpaut 0,714 detik.
Meskipun demikian, rookie MotoGP ini berhasil mengungguli pebalap Ducati, Nicky Hayden, pebalap Tech 3 Andrea Dovizioso, serta juara dunia tujuh kali MotoGP yang merupakan rekan setim Hayden, Valentino Rossi. Posisi ke-10 ditempati pebalap CRT, Aleix Espargaro.
Alvaro Bautista, yang pekan lalu menjadi penyebab Lorenzo gagal mencetak poin di Assen, Belanda, menempati peringkat ke-11. Tetapi, hasil kualikasi ini tak berpengaruh, karena pebalap Gresini Honda ini harus start dari posisi paling belakang menyusul hukuman yang dijatuhkan kepadanya (akibat insiden di Assen).
Hasil kualifikasi GP Jerman
1. Casey Stoner AUS Repsol Honda (RC213V) 1m 31.796s
2. Ben Spies USA Yamaha Factory Racing (YZR-M1) 1m 31.989s
3. Dani Pedrosa ESP Repsol Honda (RC213V) 1m 32.081s
4. Cal Crutchlow GBR Monster Yamaha Tech 3 (YZR-M1) 1m 32.288s
5. Jorge Lorenzo ESP Yamaha Factory Racing (YZR-M1) 1m 32.381s
6. Stefan Bradl GER LCR Honda MotoGP (RC213V) 1m 32.510s
7. Nicky Hayden USA Ducati Team (GP12) 1m 32.795s
8. Andrea Dovizioso ITA Monster Yamaha Tech 3 (YZR-M1) 1m 33.205s
9. Valentino Rossi ITA Ducati Team (GP12) 1m 33.217s
10. Aleix Espargaro ESP Power Electronics Aspar (ART CRT) 1m 33.900s
11. Alvaro Bautista ESP San Carlo Honda Gresini (RC213V) 1m 34.088s
12. Hector Barbera ESP Pramac Racing (GP12) 1m 34.542s
13. Colin Edwards USA NGM Forward Racing (Suter-BMW CRT) 1m 34.649s
14. Randy De Puniet FRA Power Electronics Aspar (ART CRT) 1m 34.651s
15. Mattia Pasini ITA Speed Master (ART CRT) 1m 34.938s
16. Danilo Petrucci ITA Came IodaRacing (Ioda-Aprilia CRT) 1m 35.590s
17. Michele Pirro ITA San Carlo Honda Gresini (FTR-Honda CRT) 1m 35.595s
18. Yonny Hernandez COL Avintia Blusens (FTR-Kawasaki CRT) 1m 35.962s
19. Ivan Silva ESP Avintia Blusens (FTR-Kawasaki CRT) 1m 36.183s
20. James Ellison GBR Paul Bird Motorsport (ART CRT) 1m 36.355s
21. Franco Battaini ITA Cardion AB Motoracing (GP12) 1m 36.438s
